Spartak Trnava potvrdil v domácom prostredí úlohu favorita a proti druholigovému MFK Tatran Liptovský Mikuláš vyhral rozdielom triedy 3:0. V ďalších zápasoch už mužstvá z nižších súťaží papierových favoritov výrazne potrápili. Seničania vybojovali postup do ďalšieho kola na ihrisku druholigového MŠK Rimavská Sobota po strelách zo značky pokutového kopu v pomere 6:5. Penaltovú lotériu zvládli aj futbalisti MFK Košice v Seredi. Domáce mužstvo vyrovnalo skóre tri minúty pred koncom riadneho hracieho času na 1:1, no penalty zvádli lepšie hostia z Košíc. Do tretice pečatil postup po penaltách MFK Ružomberok. Po bezgólovej remíze uspeli domáci proti MFK Zemplín Michalovce na penalty 5:4.

Zaujímavý priebeh mal aj zápas v Zlatých Moravciach. ViOn viedol už trojgólovým rozdielom, no druholigový FK Slovan Duslo Šaľa dokázal zdramatizovať priebeh zápasu dvomi gólmi v závere. VioN Zlaté Moravce tak vybojoval postup po výsledku 3:2. Štvrťfinále Slovnaft Cupu bude mať aj druholigového účastníka. Na domácej pôde zdolal prešovský Tatran gólom Poliačeka v 81. minúte DAC Dunajská Streda 1:0.

MŠK Rimavská Sobota - FK Senica 1:1 (0:1), p.k. 5:6 

do štvrťfinále Slovnaft Cupu postúpila Senica

Góly: 84. J. Zvara - 32. Tsoumou
R: Sedlák, 588 divákov

ŠKF Sereď - MFK Košice 1:1 (0:0), p.k. 2:3 

do štvrťfinále Slovnaft Cupu postúpili Košice

Góly: 87. Scherhaufer - 61. Hovančík
R: P. Hrčka, 846 divákov

FC ViOn Zlaté Moravce - FK Slovan Duslo Šaľa 3:2 (2:0)

do štvrťfinále Slovnaft Cupu postúpili Zlaté Moravce

Góly: 24. a 42. Pribula, 58. P. Orávik - 71. Numeric, 81. Konopásek
R: Trutz, 560 divákov

1. FC Tatran Prešov - FK DAC 1904 Dun. Streda 1:0 (0:0)

do štvrťfinále Slovnaft Cupu postúpil Prešov

Gól: 81. M. Poliaček
R: K. Horváth, 613 divákov 

FC Spartak Trnava - MFK Tatran Lipt. Mikuláš 3:0 (2:0)

do štvrťfinále Slovnaft Cupu postúpila Trnava

Góly: 2. R. Procházka, 29. Augustini, 62. Poznar
R: Smolák, 915 divákov

MFK Ružomberok - MFK Zemplín Michalovce 0:0, p.k. 5:4

do štvrťfinále Slovnaft Cupu postúpil Ružomberok

R: Hracho, 1212 divákov 

Zostávajúci program zápasov 3. kola futbalového Slovnaft Cupu

Streda 25. septembra (oba duely majú výkop o 16:00)
FKS Nemšová - MŠK Žilina (Jurenka - D. Hrčka, Hancko)
OFK Dunajská Lužná - ŠK Slovan Bratislava (Pavlík - T. Somoláni, Bednár)