V doterajších 19 ročníkoch Slovenského pohára sa na listine najlepších strelcov ocitlo 39 mien. Dvaja hráči dvakrát - Ľubomír Luhový (1993/94 a 1996/97 v drese Interu Bratislava) a Andrej Hodek (2009/10 a 2011/12 Artmedia Petržalka a ViOn Zlaté Moravce). Najviac gólov v jednom ročníku zaznamenal v sezóne 1995/96 legionár z Ukrajiny v drese Chemlonu Humenné - 8 gólov. Naopak, iba 3 góly stačili na titul najlepšieho strelca v sezónach 1998/99 (8 hráčov) a 2002/03 (6 hráčov).

V aktuálnom ročníku sa pred finálovým zápasom v Ružomberku ocitli na čele tabuľky kanonierov Róbert Pich z MŠK Žilina (5 gólov) a stredopoliar Slovana Bratislava Marko Milinkovič (4 góly). Vzhľadom k skutočnosti, že nikto z kvarteta trojgólových strelcov už nemôže svoje gólové konto navýšiť, môžeme očakávať zajtra v Ružomberku aj priamy súboj o najlepšieho strelca Slovnaft Cupu 2012/2013.

NAJLEPŠÍ STRELCI JEDNOTLIVÝCH ROČNÍKOV:

1993-1994        4 góly:         Ľubomír Luhový (Inter Bratislava)
                                            Ján Solár (Inter Bratislava)
1994-1995        4 góly:         Eugen Bari (DAC Dunajská Streda)
1995-1996        8 gólov:       Ruslan Ľubarskij - Ukrajina (Chemlon Humenné)
1996-1997        4 góly:         Ľubomír Luhový (Inter Bratislava)
                                            Ľubomír Talda (MŠK Ružomberok)
                                            Ladislav Suchánek (FKM Nové Zámky)
1997-1998        5 gólov:       Karol Kisel (Lokomotíva Košice)
                                            Rastislav Lazorík (Tatran Prešov)
1998-1999        3 góly:        Tibor Jančula (Slovan Bratislava)
                                            Ľubomír Faktor (Dukla Banská Bystrica)
                                            Vladimír Kožuch (Tatran Prešov)
                                            Jaroslav Mačák (Spartak Trnava)
                                            Milan Malatinský (Dukla Banská Bystrica)
                                            Ľubomír Meszároš (Slovan Bratislava)
                                            Imrich Miklós (Inter Bratislava)
                                            Peter Slicho (Tatran Prešov)
1999-2000        6 gólov:       Peter Černák (Nchz Nováky)
2000-2001        6 gólov:       Richard Varadín (MFK Ružomberok)
2001-2002        7 gólov:       Ľuboš Perniš (Matador Púchov)
2002-2003        3 góly:         Mário Breška (Matador Púchov)
                                            Juraj Škripec (Matador Púchov)
                                            Jaroslav Kamenský (Petrochema Dubová)
                                            Peter Stacho (Petrochema Dubová)
                                            Michal Kovan (FC Nitra)
                                            Róbert Vittek (Slovan Bratislava)
2003-2004        5 gólov:       Miroslav Kriss (Spartak Trnava)
2004-2005        4 góly:         Stanislav Šesták (MŠK Žilina)
2005-2006        7 gólov:       Róbert Rák (FC Nitra)
2006-2007        5 gólov:       Maroš Choma (ViOn Zlaté Moravce)
2007-2008        6 gólov:       Erik Takáč (Tatran Prešov)
2008-2009        6 gólov:       Ján Novák (MFK Košice)
2009-2010        4 góly:         Roman Jurko (FK Bodva Moldava nad Bodvou)
                                            Andrej Hodek (MFK Petržalka)
2010-2011        4 góly:         Fanendo Adi - Nigéria (AS Trenčín)
                                            Momodou Ceesay - Gambia (MŠK Žilina)
                                            Higor De Sales Coimbra - Brazília (Spartak Trnava)
                                            Koro Issa Koné - Pobrežie Slonoviny (Spartak Trnava)
                                            Filip Šebo (Slovan Bratislava)
2011-2012        4 góly:         Andrej Hodek (ViOn Zlaté Moravce)
                                            Tomáš Majtán (MŠK Žilina)

NAJLEPŠÍ STRELCI SLOVNAFT CUP 2012-2013

5 gólov - Róbert Pich (MŠK Žilina)
4 góly -   Marko Milinkovič (Slovan Bratislava)
3 góly -   David Alberto Depetris (AS Trenčín)
              Dávid Škutka (MFK Košice)
              Stanislav Cuprišin (Partizán Bardejov)
              Michal Filo (ŠKF Sereď)